Este tipo de herramientas permite medir estructuras dentro de las imágenes con el fin de conocer una serie de parámetros morfométricos tales como: Área, Perímetro, Posición X,Y,

Diámetro Máximo, Forma, Circularidad…

Mediante este tipo de análisis se obtiene información estadística de los objetos. Normalmente se procede a una binarización de la imagen para obtener los parámetros de las estructuras que aparecen separadas, independientemente de la forma o complejidad, pudiendo incluso incorporar agujeros dentro de los objetos.

Entre las medidas que se pueden obtener se encuentran: número de objetos, número de agujeros, centroide de los objetos, diámetro, primer y segundo momento, perímetro, número de píxeles de un objeto, recuadro que enmarca el objeto, puntos pertenecientes al perímetro convexo.

Este tipo de herramientas permite clasificar o eliminar los objetos por: límite de tamaño, límite de altura, límite de anchura, límite de número de agujeros en un objeto, objetos que tocan el límite del área de interés.